1959年：由印尼青年归侨周才喜等7人在厦门市侨联积极支持下，创办了“厦门华侨热带作物试验场”，场址设在厦门市鼓浪屿博爱路口（现改为鹿礁路）。
1961年：厦门华侨热带作物试验场（对外称厦门华侨亚热带植物引种场）划归正在筹建的厦门市植物研究所，选址鼓浪屿鼓声路4号。原厦门市副市长许祖义兼任筹建处主任 原厦门市科委副主任罗林、厦门大学严楚江教授兼任副主任。
1962年：厦门华侨亚热带植物引种场划归中国科学院华东亚热带植物研究所（1975年改名福建省亚热带植物研究所），受厦门市及该所双重领导。
1964年：中国科学院院长郭沫若亲临引种场视察指导工作，他充分肯定引种场创建的成 绩，并风趣地说道:“从海外引进的优良品种，如能驯化推广成功，也不亚于一颗原子弹爆炸”。
1976年：在中国科学院院长方毅的关心过问下，福建省革命委员会决定复办引种场，由福建省科委责成福建省亚热带植物研究所着手进行恢复重建工作。
1981年：中共厦门市委下达了【1981】154号文件，并召开大会，专为厦门华侨亚热带植物引种场落实政策，平反正名，极大地鼓舞了海内外侨胞和爱国人士报效祖国热情与决心，他们称赞共产党政策好，欢呼引种场重获新生。
1984年：厦门华侨亚热带植物引种场脱离福建省亚热带植物研究所，划归厦门市科委及厦门市侨办双重领导，并更名为“厦门华侨亚热带植物引种园”。
1985年：组建了“厦门华侨园艺技术开发公司”，并以该公司为载体，由厦门市侨联牵线，与“香港缤纷园艺公司”合资100万港元创办了“厦门侨缤园艺公司”。开创了我国通过国际商业引进观赏植物（珍贵花卉）的先河。
1987年：我园主持的国家“七.五”重点工业性试验项目“农作物国外引种隔离检疫基地”通过国家计委立项。该项目总投资315万元，是全国仅有两个点中设在南方的一个。 该基地1992年9月通过国家鉴定验收，并正式投入使用。
1987年：同年成立了厦门华侨植物联络会，联络会会长由厦门市侨办主任林华明兼任。
2000年：通过厦门市市属科研院所科技体制改革，定性为非营利性公益类科研机构。
2004年：厦门华侨亚热带植物引种园划归厦门市鼓浪屿—万石山风景区管委会和厦门市侨办双重领导，业务由厦门市科技局主管。
2004年：确立全面落实科学发展观，走产学研结合道路，构建植物引种与检疫学科体系，依托“农作物国外引种隔离检疫基地”科研技术条件，建设厦门市植物引种检疫与天然   产物研发重点实验室的科研计划行动。
2005年：全面实施“以科研为主，科普为辅，适当发展旅游，重点突出“亚热带植物” 和“引种园”的特色”的观光园建设。
2006年：获得“厦门市科普教育基地”荣誉称号。
2007年：建成了引种热带果树、南方药用植物和观赏植物三大特色专类园区。
2008年：获得“福建省科普教育基地”荣誉称号。
2009年：与华侨大学化工学院共建了”生化与分子生物学专业硕士研究生联合培养点”，拥有2位硕士生导师，正式开始招生培养硕士研究生。
2009年：与厦门国际航空港花卉有限公司联合建立了“兰花脱毒种苗与遗传育种研究中心”。
2009年：与厦门绿色乡村生态科技有限公司合作建立了70亩“南亚热带果树推广示范基地”。